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| 1 | Structure-based assessment of disease- related mutations in human voltage-gated sodium channels显示文摘电压门钠(Nav ) 隧道为行动潜力和在神经和肌肉的电的信号的繁殖的快速的向上的一击是必要的。Nav 隧道的缺点与许多 channelopathies 被联系。超过 1000 个疾病相关的变化在 Nav 隧道被识别了,与怀有超过 400 个变化的 Nav1.1 和 Nav1.5 各个。Nav 隧道为神经毒素和药的一个宽数组代表主要目标。Nav 隧道的原子结构被要求理解他们的功能和疾病机制。兔子电压门钙(Cav ) 的最近坚定的原子结构隧道 Cav1.1 为 evolutionarily 相关的 Nav 隧道的基于相同的结构的建模提供一个模板。在这篇资源文章,我们在人的 Nav 隧道总结了所有报导疾病相关的变化,产生了人的 Nav1.7 的一个相应模型,并且在结构上印射联系疾病的变化。在人的 Nav 隧道的结构的决心前,这里介绍的分析为 Nav channelopathies 的机械学的调查并且为潜在的基于结构的药发现用作基础框架。 | Weiyun Huang Minhao Liu S. Frank Yan Nieng Yan | 2017 | Protein & Cell2017,8,6: | 8 |
| 2 | Complex structure of the fission yeast SREBP-SCAP binding domains reveals an oligomeric organization显示文摘甾醇规章的元素绑定蛋白质(SREBP ) 抄写因素是在哺乳动物和在真菌的 hypoxic 改编的氧应答的管理者的细胞的类脂化合物动态平衡的主人管理者。SREBP C 终点绑在 SREBP 激活劈开的蛋白质(SCAP ) 的 WD40 领域,它由在 Golgi 控制到激活的朊酶的 SREBP-SCAP 建筑群和存取的 ER-to-Golgi 运输授与甾醇规定。这里,我们生物化学地并且在结构上表演 Sre1 和 Scp1,分裂酵母 SREBP 和 SCAP 的 carboxyl 终端域(CTD ) ,形成功能的 4:4 oligomer 和 Sre1-CTD 形式一 dimers 更暗淡。在 3.5 Å 的 Sre1-CTD 的水晶结构;并且在 5.4 Å 的建筑群的 cryo 他们结构;和在 vitro 生物化学的证据阐明在为 Scp1 绑定, Sre1-CTD dimerization 和 tetrameric 要求的 Sre1-CTD 的三个不同区域形成。最后,这些在结构上鉴别领域在细胞的上下文被验证,证明合适的 4:4 oligomeric 建筑群形成为 Sre1 激活被要求。 | Xin Gong Hongwu Qian Wei Shao Jingxian Li Jianping Wu Jun-Jie Liu Wenqi Li Hong-Wei Wang Peter Espenshade Nieng Yan | 2016 | Cell Research2016,26,11: | 6 |
| 3 | The Central domain of RyR1 is the transducer for long-range allosteric gating of channel opening显示文摘ryanodine 受体(RyRs ) 是为从 sarcoplasmic/endoplasmic 蜂窝胃(SR/ER ) 的 Ca 2+ 的快速的版本负责的细胞内部的钙隧道到细胞质,它为心脏、骨胳的肌肉联合的刺激收缩(E-C ) 是必要的。关上的 RyR1 的在原子附近的决定结构披露了这条庞大的隧道的分子的详情,当远程的 allosteric gating 机制等候说明时。这里,我们报导在三的兔子 RyR1 的 cryo 他们结构在大约 4 Å 关上了符合构造;在 5.7 Å 的分辨率和一个开的状态;。关上的 RyR1 结构的比较显示出细胞质的站台的一个呼吸运动,当隧道领域和它的连续中央领域仍然保持将近未改变时。户外和关上的结构的比较在导致隧道开的细胞质的门显示出 S6 tetrahelical 捆的膨胀。在毛孔开始期间,细胞质的 “ O-ring”隧道领域的主题和中央领域展览的 U 主题联合了运动,当中央领域经历域明智的排水量时。这些结构的分析提供重要卓见进在骨胳的肌肉联合的 E-C 并且作为联合细胞质的平台的 conformational 变化到中央毛孔的 gating 的变换器识别中央域。 | Xiao-Chen Bai Zhen Yan Jianping Wu Zhangqiang Li Nieng Yan | 2016 | Cell Research2016,26,9: | 4 |
| 4 | The recombinant expression systems for structure determination of eukaryotic membrane proteins显示文摘真核细胞的膜蛋白质,许多哪个是在各种各样的生物过程的关键播放器,多于药目标的一半组成并且代表结构的研究的重要候选人。与他们的生理的意义相对照,真核细胞的膜蛋白质结构的仅仅很有限的数字在 recombinant 蛋白质的产生由于技术挑战被获得了。在这评论,我们为真核细胞的膜蛋白质检验主要 recombinant 表示系统并且比较他们的相对优点和劣势。我们也试图在真核细胞的膜蛋白质纯化和结晶化的前进总结最近的技术策略。 | Yuan He Kan Wang Nieng Yan | 2014 | Protein & Cell2014,5,9: | 4 |
| 5 | Revisiting the TALE repeat显示文摘抄写像使活跃之物(TAL ) 受动器明确地绑加倍搁浅(ds ) 通过双人脚踏车的一个中央领域的 DNA 重复。每次 TAL 受动器(故事) 重复包括 3335 氨基酸并且在重复在一个固定位置通过高度可变的残余认出一个特定的 DNA 库。结构的研究由故事重复揭示了 DNA 识别的分子的基础。全面结构的检查表明故事蛋白质的基本积木,也就是一个螺旋状的发卡,一个螺旋从以前定义的故事主题被转移。这里,我们希望建议以绑在 DNA 脊梁磷酸盐的残余开始并且与基础识别的超残余得出结论的 TALE 重复的基于结构的重新分界。这个新数系统与到哪个故事合适的螺线管总科一致,并且反映 TAL 受动器的结构的正直。另外,它授与匹配界限 DNA 库的数字的故事重复的不可分的数字。我们然后与目标 DNA 分子在建筑群介绍设计 dHax3 变体的十五水晶结构,它阐明库腺嘌(A) 和 guanine (G) 由的识别的结构的基础报导或 uncharacterized 故事代码。最后,我们在一次故事重复以内分析了氨基酸残余的顺序结构关联。这里报导的结构的分析可以推进故事蛋白质的机械学的理解并且与改进亲密关系和特性便于 TALEN 的设计。 | Dong Deng Chuangye Yan Jianping Wu Xiaojing Pan Nieng Yan | 2014 | Protein & Cell2014,5,4: | 3 |
| 6 | Crystal structure of a bacterial homologue of SWEET transporters显示文摘 | Jing Wang Chuangye Yan Yini Li Kunio Hirata Masaki Yamamoto Nieng Yan Qi Hu | 2014 | Cell Research2014,24,12: | 3 |
| 7 | Structure of the WD40 domain of SCAP from fission yeast reveals the molecular basis for SREBP recognition显示文摘 | Xin Gong Jingxian Li Wei Shao Jianping Wu Hongwu Qian Ruobing Ren Peter Espenshade Nieng Yan | 2015 | Cell Research2015,25,4: | 3 |
| 8 | Specific RNA Recognition by Designer Pentatricopeptide Repeat Protein显示文摘由设计者 Pentatricopeptide 重复蛋白质 dPPR 的特定的 RNA 识别。 | Cuicui Shen Xiang Wang Yexing Liu Quanxiu Li Zhao Yang Nieng Yan Tingting Zou Ping Yin | 2015 | Molecular Plant2015,8,4: | 2 |
| 9 | Structural basis for pore blockade of human voltage-gated calcium channel Cav1.3 by motion sickness drug cinnarizine显示文摘Dear Editor,Voltage-gated calcium(Cav)channels regulate a broad range of physiological processes,such as muscle contraction,synaptic signal transduction,and hormone secretion.1 Cav1.3 channels belong to the L-type(L for long-lasting current)Cav subfamily(LTCC)and display diverse tissue distributions in brain,ear,heart,and endocrine organs.2 Of note,Cav1.3 channels are predominantly expressed in cochlea inner hair cells,whose normal development and synaptic transmission are crucial for proper auditory function.3 Therapeutic agents targeting Cav1.3 channels hold promises for Parkinson’s disease,resistant hypertension,and hearing dysfunction.4 In addition to the widely prescribed dihydropyridine(DHP),phenylalkylamine(PAA),and benzothiazepine(BTZ)drugs,Cav1.3 channels are subject to regulation by compounds with the diphenylmethylpiperazine(DPP)core group。 | Xia Yao Shuai Gao Nieng Yan | 2022 | Cell Research2022,32,10: | 1 |
| 10 | Analysis of the selectivity filter of the voltage-gated sodium channel NavRh显示文摘NaChBac 是细菌的电压门钠(Na 显示出顺序类似到电压门钙隧道的 v ) 隧道。理解 Na v 隧道,我们联合了调查 Na v Rh,海洋的细菌的 NaChBac ortholog。二个 Na + 绑定地点在我们的模拟在选择过滤器(SF ) 被识别:首先,途径地点 1 由方面组成了的细胞外的 Na + 离子 Ser181 和 Glu183 组织,然后自发地到达精力充沛地 2 由 Leu179 和 Thr178 的羰基氧形成了的更有利的地点。相反, Ca 2+ 离子对被 Glu183 在地点 1 点套住敏感,它然后堵住 Na + 和 Ca 2+ 的入口到 SF 的门厅。另外, Na + 以一种不均匀的方式通过选择过滤器渗入,类似于哺乳动物的 Na v orthologs。这里报导的学习在哺乳动物的 Na 2+ 上在 Na + 上提供卓见进离子选择的机制 > v 隧道。 | Xu Zhang Mengdie Xia Yang Li Huihui Liu Xin Jiang Wenlin Ren Jianping Wu Paul DeCaen Feng Yu Sheng Huang Jianhua He David E Clapham Nieng Yan Haipeng Gong | 2013 | Cell Research2013,23,3: | 1 |
| 11 | Simulating the ion permeation and ion selection for a eukaryotic voltage-gated sodium channel NavPaS显示文摘 | Juanrong Zhang Wenzhi Mao Yanhui Ren Rui-Ning Sun Nieng Yan Haipeng Gong | 2018 | Protein & Cell2018,9,6: | 1 |
| 12 | Dimeric structure of the uracil:proton symporter UraA provides mechanistic insights into the SLC4/23/26 transporters显示文摘Escherichia coli uracil:proton symporter UraA 是 nucleobase/ascorbate transporter (NAT ) 或 nucleobase/cation symporter 的一个原型的成员 2 (NCS2 ) 家庭,它对应于人的溶质搬运人家庭 SLC23。UraA 由被组织成二个不同领域,核心领域和门领域的 14 个 transmembrane 片断(TM ) 组成,也是的结构的褶层由 SLC4 和 SLC26 transporters 分享了。这里我们在场 UraA 的水晶结构在 2.5 点处于一个堵塞状态跳了到 uracil?分辨率。有以前报导的里面打开 UraA 的结构的比较象门领域的 intra 域重新整理一样揭示在核心领域和门领域之间的显著相对运动。堵塞 UraA 形式一在门领域被二个核心领域夹的结构更暗淡。在 vitro 并且在生物化学的描述显示出的 vivo,那 UraA 在平衡在之间更暗淡并且在所有测试净化的微粒的单体,当更暗淡的形成为运输活动是必要的时。在二聚的 UraA 和最近报导的里面面对的二聚的 UapA 之间的结构的比较提供重要卓见进 SLC23 transporters 的运输机制。 | Xinzhe Yu Guanghui Yang Chuangye Yan Javier L Baylon Jing Jiang He Fan Guifeng Lu Kazuya Hasegawa Hideo Okumura Tingliang Wang Emad Tajkhorshid Shuo Li Nieng Yan | 2017 | Cell Research2017,27,8: | 1 |
| 13 | Cryo-EM structure of L-fucokinase/GDP-fucose pyrophosphorylase(FKP)in Bacteroides fragilis显示文摘Dear Editor,L-Fucose(6-deoxy-L-galactose,fucose)is the basic compone nt of a variety of glyca n structures.The fucosylated oligosaccharides participate in a variety of cellular activities,like the cell-cell recognition,selectin-mediated leukocyteendothelial adhesion and the formation of Lewis blood group antigens(Ma et al.,2006).GDP-fucose is an important fucose donor in the process of fucosylated oligosaccharides formation.Two pathways of GDP-fucose synthesis are present in the cytosol of mammalian cells,including the de novo pathway and the salvage pathway(Becker et al.,2003).In the salvage pathway,cells use fucose from the extracellular or lysosomal sources to synthesize GDP-fucose. | Ying Liu Huifang Hu Jia Wang Qiang Zhou Peng Wu Nieng Yan Hong-Wei Wang Jia-Wei Wu Linfeng Sun | 2019 | Protein & Cell2019,10,5: | 0 |