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| 1 | 一种改进的动物线粒体DNA提取方法显示文摘线粒体DNA(mtDNA)已被广泛用于动物群体遗传学和进化生物学的研究,并取得了许多有意义的结果。有效的mtDNA提取方法无疑是开展这方面研究的前提。关于动物mtDNA的提取方法,国内外已有不少报导。概括起来,可分为:1)氯化铯超速离心法,2)柱层析法,3)DNase法,4)碱变性法。本文报道了一种改进的碱变性提取法,与其它方法相比,具有应用范围广、简便、经济等优点。 | 王文 施立明 | 1993 | Zoological Research1993，14，2： | 118 |
| 2 | 利用mtDNA COⅠ基因序列鉴定我国烟粉虱的生物型显示文摘利用mtDNACOⅠ基因片段作标记 ,采用序列分析的方法 ,从分子生态学的角度研究了近年来在我国暴发危害的烟粉虱Bemisiatabaci 5个种群 (北京一品红种群 ,广州甘蓝种群 ,西安一品红种群 ,北京西红柿种群和新疆吐鲁番棉花种群 )的生物型。在 5个种群的基因片段上 ,截取与Texas B型相应的 72 0bp的序列分析 ,结果表明所测序列中只有 2个碱基与Texas B型不同 ,序列相似性为 99 7% ;在西安一品红种群和新疆吐鲁番棉花种群的原序列中截取与Arizona B型序列相应的4 2 3bp片段 ,分析表明这两个种群与AZB3型属于同一个单倍型。因此 ,我国烟粉虱 5个实验种群的生物型与Texas B型和Arizona B型种群为同一生物型“B”。 | 罗晨 姚远 王戎疆 阎凤鸣 胡敦孝 张芝利 | 2002 | 昆虫学报2002，45，6： | 204 |
| 3 | 云南黄牛和大额牛的mtDNA多态性研究显示文摘本文以mtDNA限制性内切酶片段长度多态技术分析云南牛的mtDNA多态性。结果表明云南黄牛有两种类型的mtDNA分子,一种是普通黄牛类型,另一种是瘤牛类型,两者的频率分别为33%和67%。没有发现过渡型和重组型。昆明黑白花奶牛的mtDNA与云南黄牛的相类似。云南黄牛可能具有两种起源,即普通黄牛起源和瘤牛起源。今天的云南黄牛群体是这两种类型的混合。大额牛的限制性类型与瘤牛相同,表明大额牛的起源与瘤牛有密切关系。 | 兰宏 熊习昆 林世英 刘爱华 施立明 | 1993 | Acta Genetica Sinica1993，20，5： | 56 |
| 4 | 贵州四个山羊品种mtDNA多态性及起源分化显示文摘采用15种限制性内切酶,研究贵州省4个山羊(caprasp.)品种共93只个体的线粒体DNA多态性。其中BamHⅠ、HindⅢ和SalⅠ3种酶的酶切类型存在多态。共检测到18种限制性态型,归结为3种mtDNA单倍型。单倍型Ⅰ和Ⅱ在贵州山羊4个品种中分布频率较高,分别为7742%和2150%,单倍型Ⅲ分布频率较低(108%);品种间亲缘关系聚类分析表明白山羊和黑山羊亲缘关系最近,其次为黔北麻羊,而与小香羊的亲缘关系最远。推测贵州山羊mtDNA单倍型Ⅰ和Ⅱ可能来源于两个母系祖先,其分化时间约在19万年前。 | 贾永红 史宪伟 简承松 朱文适 张亚平 何正权 廖正录 余应淮 李通权 | 1999 | Zoological Research1999，20，2： | 60 |
| 5 | 线粒体DNA用作分子标记的可靠性和研究前景显示文摘mtDNA作为分子标记的广泛应用 ,使得系统进化、生物地理、群体遗传、人类学及法医鉴定等领域的研究得到前所未有的发展。但随着对线粒体基因组遗传特性的了解不断加深 ,以mtDNA作为分子标记的潜在问题便逐渐暴露出来。本文从 7个方面对mtDNA应用的可靠性问题进行了讨论 ,并对今后线粒体基因的应用前景做了初步分析。 | 牛屹东 李明 魏辅文 冯祚建 | 2001 | 遗传2001，23，6： | 55 |
| 6 | 西南地区家猪和野猪mtDNA遗传多样性研究显示文摘本实验用ApaI、AvaI、BamHI、BclI、BglII、BglII、ClaI、EcoRI、EcoRV、HindIII、Hpal、KpnI、PstI、PvuII、SacI、SalI、ScaI、SmaI、XbaI和XhoI等20种限制性内切酶分析来自中国西南地区的家猪和野猪的mtDNA群体遗传多样性。结果表明:在全部28只个体中,共检出26种限制性态型(morph),归结为6种不同的限制性类型,限制性类型的差异主要来源于少数几个限制性位点的偶然突变。利用现代分子群体遗传学方法,对这些猪的遗传多样性进行评估,结果表明中国西南地区猪的mtDNA变异度很低,遗传多样性贫乏,提示西南地区的猪起源于一个共同的祖先,在品种形成的早期可能受到创立者效应的制约。 | 兰宏 王文 施立明 | 1995 | Acta Genetica Sinica1995，22，1： | 42 |
| 7 | 中国5种珍稀绢蝶非损伤性取样的mtDNA序列及系统进化显示文摘应用非损伤性取样DNA测序技术测定了4种来自云南白马雪山和1种来自新疆天山的5种珍稀绢蝶的线粒体DNA细胞色素b基因部分DNA序列。在获得的433bp的序列中,A+T约占754%,其中40个核苷酸位点存在变异(约924%)。DNA一级序列数据显示,该5种绢蝶间DNA序列变异丰富。PAUP3.1.1(简约法)数据分析软件构建该5个种绢蝶的分子系统树显示,爱珂绢蝶(Parnassiusacco)和巴裔绢蝶(Parnassiusbaileyi)的亲缘关系比较接近,阿波罗绢蝶(Parnassiusapollo)、珍珠绢蝶(Parnassiusorlears)和西猴绢蝶(Parnassiussimo)3种绢蝶均为相对独立的一支,其中西猴绢蝶分化较早,与形态学研究结果相吻合。 | 陈永久 张亚平 沈发荣 张云武 杨大荣 聂龙 杨跃雄 | 1999 | Acta Genetica Sinica1999，26，3： | 45 |
| 8 | 蝗总科部分种类Cytb基因序列及系统进化研究显示文摘蝗总科 8个科 10个种的线粒体DNA细胞色素b (Cytb)基因部分序列被测定分析 ,比较同源性 ,计算核苷酸使用频率并构建NJ分子系统树。在获得的 4 32bp的序列中 ,A +T约占 70 4 % ,其中 177个核苷酸位点存在变异(约占 4 1 0 % ) ,DNA一级序列数据显示 ,该 8科蝗虫间DNA序列变异丰富。用日本蚱作外群构建的NJ树表明 :瘤锥蝗科较为原始 ,而癞蝗科与槌角蝗科关系较近 ,为比较进化的类群 ,蝗总科 8科的起源关系为 :瘤锥蝗科→斑翅蝗科和锥头蝗科→斑腿蝗科→剑角蝗科→网翅蝗科→槌角蝗科和癞蝗科 ,上述研究结果与传统形态分类学结论不完全一致 。 | 任竹梅 马恩波 郭亚平 | 2002 | Acta Genetica Sinica2002，29，4： | 48 |
| 9 | 用mtDNA D-环序列探讨蒙古和中国绵羊的起源及遗传多样性显示文摘为了在分子水平上探讨绵羊的起源,对中国和蒙古共20个绵羊群体、314只绵羊mtDNAD环的部分序列进行了测定。结果表明:中国绵羊和蒙古绵羊mtDNAD环区的部分序列中A、T、G、C含量没有明显的差别;蒙古绵羊的多态位点数(26.85%)略高于中国绵羊(24.22%);中国绵羊群体的单倍型多样度在青海藏羊、甘肃藏羊、甘肃高山细毛羊、青海细毛羊、甘南藏羊、小尾寒羊和滩羊群体中较高,但在湖羊和岷县黑裘皮羊中较低;蒙古绵羊的单倍型多样度在Bayad和Baidrag群体中最高,但在GobiAltai群体中最低。从总体上看,蒙古绵羊的遗传多样性要略高于中国绵羊,例如单倍型比例的平均值为86.06%(142/165)∶78.83%(108/137),单倍型多样度(Hd)的平均值为0.976∶0.936,核苷酸多样度(Pi(π))的平均值为0.036∶0.034,平均核苷酸差异数(k)的平均值为23.50∶22.46。217个中国和蒙古绵羊的单倍型序列的系统发生分析表明,中国和蒙古绵羊均有3个母系起源,被定义为A、B和C3类主要的单倍型。其中A类单倍型在所有中国绵羊群体及绝大多数蒙古绵羊群体(9/11)中占优势,平均比例为58.73%;B类单倍型居中,为24.68%;C类单倍型最少,仅为16.59%。进一步从GenBank获得的91个绵羊D环区的序列与中国和蒙古绵羊D环区的单倍型的进行网络关系分析,发现欧洲摩弗仑羊(Europeanmouflon,O.musimon)与中国和蒙古绵羊具有较近的亲缘关系,但没有发现羱羊(Argali,O.ammon)、盘羊(O.vigneibochariensis)和东方盘羊(O.ammonnigrimontana)对中国和蒙古绵羊起源有贡献的证据。 | 罗玉柱 成述儒 Batsuuri Lkhagva D.Badamdorj Olivier Hanotte 韩建林 | 2005 | Acta Genetica Sinica2005，32，12： | 38 |
| 10 | 线粒体COⅠ基因在昆虫DNA条形码中的研究与应用显示文摘自2003年DNA条形码(DNA barcodes)概念出现以来,DNA条形码技术(DNA barcoding)受到生物分类学领域普遍关注,线粒体细胞色素氧化酶亚基I(mtDNACOⅠ)被用作动物类群的主要条形码序列,基于该基因片段的昆虫条形码研究在国内外广泛开展。本文在概述DNA条形码、条形码技术及已开展的昆虫条形码研究计划的基础上,总结了昆虫mtDNACOⅠ条形码及其技术在发现和描述隐种、种类分子鉴定以及系统发育等方面的研究进展,分析了细胞核线粒体假基因(Numts)对mtDNACOⅠ条形码扩增的影响,提出检测和避免Numts的方法,并对DNA条形码技术的进一步研究和应用进行了讨论和展望。 | 杨倩倩 李志红 伍祎 柳丽君 | 2012 | 应用昆虫学报2012，49，6： | 37 |
| 11 | 食品及饲料中马属动物源性成分的PCR检测研究显示文摘采用马和驴mtDNA中特异性片段引物 ,利用聚合酶链反应技术 (polymerasechainreaction ,PCR) ,建立了饲料中马属动物源性动物成分的快速检测方法。通过内切酶HaeⅢ、Sau3A和AluⅠ可对扩增结果进行验证并能够区分马成分和驴成分。扩增产物测序结果表明 :驴扩增产物序列与数据库序列完全一致 ,马样品扩增产物与数据库序列的同源性达 99%。该方法的检测低限分别为 0 5 %(w w)和 0 2 5 %(w w) 。 | 陈颖 吴亚君 徐宝梁 马颖 董萌 | 2004 | 中国生物工程杂志2004，24，5： | 35 |
| 12 | 山羊mtDNA多态性及其起源分化研究显示文摘本文用14种识别6碱基的限制性内切酶ApaⅠ、BamHⅠ、BglⅠ、BglⅡ、DraⅠ、EcoRⅠ、EcoRⅤ、KpnⅠ、PvuⅡ、PstⅠ、SacⅠ、SalⅠ、SmaⅠ和XhoⅠ研究了来自我国12个省和自治区共计18个地方山羊品种218个个体mtDNA的RFLP,并运用Nei氏公式计算了各限制性类型间的遗传距离P和群体遗传多态度π值。结果表明,在研究的所有个体中共检测到41个酶切位点,18种限制性态型,其中BamHⅠ、BglⅡ、DraⅠ、EcoRⅠ和SalⅠ共5种酶表现出多态。18种限制性态型可归结为6种基因单倍型,单倍型Ⅰ(BamHⅠB、BglⅡA、DraⅠA、EcoRⅠA和SalⅠA)和单倍型Ⅱ(BamHⅠB、BglⅡA、DraⅠA、EcoRⅠA和SalⅠB)为两种基本单倍型,研究结果提示我国地方山羊品种起源于两种不同的母系祖先。各限制性类型间的平均遗传距离为000436,整个群体的平均遗传多态度π值为00487%,表明我国地方山羊品种mtDNA遗传多样性比较贫乏,分化程度较低。 | 李祥龙 张亚平 陈圣偶 曾凡同 邱祥聘 刘相模 | 1999 | 畜牧兽医学报1999，30，4： | 32 |
| 13 | 鱼类线粒体DNA及其研究进展显示文摘鱼类是脊椎动物中最原始而在种属数量上又最占优势的类群,其起源复杂,分布广泛,拥有丰富的遗传多样性。鱼类线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)同其他脊椎动物的mtRNA一样,呈共价闭合环状,是细胞核外具自主复制、转录和翻译能力的遗传因子。与核DNA相比,鱼类mtDNA具有分子较小、结构简单、进化速度快、遗传相对独立性和母系遗传等特点,是一个相对独立的复制单位。由于鱼类线粒体DNA具有上述特点,以mtDNA作为分子标记,探讨鱼类的群体遗传结构与系统演化,已成为鱼类分子群体遗传学和系统学研究中的热点。综述了鱼类mtDNA的结构特征、进化和多态性检测方法及其在鱼类分子群体遗传学和鱼类系统学研究中的应用。 | 陈四海 区又君 李加儿 | 2011 | 生物技术通报2011，27，3： | 33 |
| 14 | 西藏牦牛mtDNA D-loop区的遗传多样性及其遗传分化显示文摘通过测定和分析西藏11个牦牛类群114个个体的mtDNA D-loop区全序列,对西藏牦牛的遗传多样性、类群间的亲缘关系及其遗传分化进行了研究。结果表明:①西藏牦牛mtDNA D-loop区全序列长度为890—896 bp,4种核苷酸T、C、A、G的平均比例分别为28.5%、25.3%、32.4%、13.8%,西藏牦牛mtDNA D-loop区富含碱基A+T,表现出一定的碱基偏好性。②共检测到130个变异位点,占分析总位点数的14.33%;其中单一多态位点85个,占多态位点总数的65.38%,简约信息位点45个,占多态位点总数的34.62%。序列变异中碱基缺失、插入和碱基替换等均有,其中碱基替换变异类型中转换114次,颠换12次,在转换变异类型中以A/G、T/C为主,占95.61%,在颠换变异类型中以A/T为主,占75%。③在114个个体中鉴定出90种单倍型,单倍型多样性为0.981±0.008,核苷酸多样性为0.01056±0.00701,均说明西藏牦牛具有丰富的单倍型类型。④90种单倍型分为2个聚类簇(Ⅰ、Ⅱ),聚类簇Ⅰ包含80种单倍型,占全部单倍型的88.89%,涵盖本研究中所有的西藏牦牛类群;聚类簇Ⅱ中有10种单倍型,占单倍型总数的11.11%,涉及的类群有工布江达、帕里、丁青、巴青、江达、类乌齐、桑桑、桑日、斯布,说明西藏牦牛可能有2个母系起源。⑤西藏牦牛类群间核苷酸分歧度(Dxy)在0.503%—1.416%之间,聚类分析和AMOVA分析显示西藏牦牛可分为两大类,康布牦牛、嘉黎牦牛为一类,其余的牦牛类群为另一类。 | 张成福 徐利娟 姬秋梅 信金伟 钟金城 | 2012 | 生态学报2012，32，5： | 32 |
| 15 | 从12SrRNA基因序列研究中国蛙科24种的进化关系显示文摘测定了中国蛙科动物 2 4种和蟾蜍科的中华大蟾蜍线粒体 12SrRNA基因长约 40 0bp片段的序列。采用邻接法 ,对其数据的系统发生分析表明 2 4种可分成 3个支系 :第一个支系包括棘腹蛙、合江棘蛙、棘胸蛙、大头蛙、虎纹蛙、倭蛙、泽陆蛙共 7种 ,其中 3种棘蛙组成一个单系 ;第二个支系由 3种湍蛙 ,即戴云湍蛙、华南湍蛙和武夷湍蛙组成 ,应属于湍蛙亚科 ;第三支系包含余下的 14种蛙 ,其中 5种林蛙和 4种臭蛙分别组成一个单系 ;2种侧褶蛙先聚合后 ,再与弹琴水蛙聚合 ,2种粗皮蛙首先聚合在一起 ,再与由林蛙组成的单系群聚合。第三支系首先与第二支系相聚 ,然后它们与第一支系形成姐妹群 ,即由蛙亚科的 7个物种组成的第一支系 ,不与蛙亚科另 14个物种组成的第三支系直接聚合 ,表明第一支系的物种可能不属于蛙亚科。此外 ,分子证据提示把陆蛙属、大头蛙属、虎纹蛙属、棘蛙属、臭蛙属、粗皮蛙属和侧褶蛙属从原来的蛙属分出有其合理性。 | 江建平 周开亚 | 2001 | 动物学报2001，47，1： | 32 |
| 16 | 小麦线粒体DNA的高效提取方法显示文摘以小麦黄化苗为材料,通过简单差速离心、DNaseⅠ处理得到无核DNA杂质的线粒体,用SDS和蛋白酶K裂解线粒体,经酚/氯仿抽提除去蛋白,并用RNase A消化而得到单纯线粒体DNA(mtDNA)。对所提取的mtDNA进行紫外吸收光度分析,A260/A280平均为1.92,A260/A230平均为2.09,平均每克黄化苗可提取mtDNA26.85μg;并对mtDNA进行琼脂糖凝胶电泳和RAPD扩增,均得到清晰的电泳图谱。结果表明:此提取方法得到的mtDNA,不但产率高、结构完整,而且能有效去除核DNA、RNA和蛋白质等杂质,获得高质量的mtDNA用于PCR反应和各种遗传学分析。研究还发现,通过调整线粒体裂解温度(先50℃裂解1h,再37℃裂解1h),亦可大幅度提高mtDNA的产率。 | 李文强 张改生 汪奎 牛娜 潘栋梁 | 2007 | 遗传2007，29，6： | 29 |
| 17 | 濒危鱼类稀有白甲鱼清水江种群mtDNA D-loop序列多态性显示文摘采用PCR、克隆结合DNA测序技术对分布于贵州清水江的30尾稀有白甲鱼个体mtDNA D-loop 3′端共计478 bp的碱基序列进行了测定分析。该序列共发现了25个多态位点,约占其核苷酸总数的5.23%。其中23个为转换位点(A-G,C-T),2个为转换与颠换同时存在的位点。30尾个体分属18种单倍型。稀有白甲鱼mtDNA核苷酸多样性(π)为0.010 7,平均核苷酸差异数(K)为5.092。单倍型多样度(H)为0.940,单倍型间平均遗传距离(P)为0.014。用单倍型间遗传距离构建的NJ系统树由2个支系组成。稀有白甲鱼清水江种群mtDNA D-loop序列存在着丰富的多态性,表明该种群具有丰富的遗传多样性。 | 彭珊 代应贵 | 2009 | 水产学报2009，33，2： | 29 |
| 18 | 不同地域小稻蝗mtDNA部分序列及其相互关系显示文摘测定了 9个不同地理区域的小稻蝗Oxyaintricata (St l)共 33个个体的线粒体DNA (mtDNA)细胞色素b基因部分序列 ,比较其同源性 ,计算核苷酸组成 ,并用瘤锥蝗科的曲尾似橄蝗Pseudomorphacrishollisi和斑腿蝗科的芋蝗Gesonulapuncti frons作外群构建NJ分子系统树。在获得的小稻蝗 432bp的序列中 ,A +T约占 70 3 % ,其中 30个核苷酸位点存在变异 (约占所测核苷酸的 6 9% ) ,有 5个位点引起了氨基酸的变异。就每个氨基酸密码子来看 ,第 3位点的A +T含量较高 ,达90 4%。由NJ树显示 ,小稻蝗mtDNA细胞色素b序列不同单倍型之间有一定的分歧 ,形成不同的簇类关系 ,其分枝与地理分布没有直接的对应关系 ,但总体上看 ,这种簇类关系基本上呈平行分布 ,没有明显的地域性差别。 | 任竹梅 马恩波 郭亚平 | 2003 | 昆虫学报2003，46，1： | 30 |
| 19 | 27种瓢虫mtDNA-COI基因序列分析及系统发育研究(鞘翅目:瓢虫科)显示文摘将自测的瓢虫科4亚科16种和从GenBank中检索到相关物种的mtDNA-COI基因编码区序列片断进行同源性比较,计算核苷酸使用频率,并构建分子系统树。在获得的471bp序列中,共有227个变异位点,195个简约信息位点,A+T约占66.7%,转换发生比颠换更频繁。分子系统树表明:同种和同属的瓢虫均以较高置信值聚在一起,4个亚科都能恢复为单系;食植瓢虫亚科从系统树的基部最早分出,是瓢虫科最为原始的类群,小毛瓢虫亚科和盔唇瓢虫亚科首先聚为一支,显示二者具有较近的亲缘关系,然后再与瓢虫亚科相聚,食植瓢虫亚科的食植瓢虫属和裂臀瓢虫属均不是单系群。 | 付景 张迎春 | 2006 | Entomotaxonomia2006，28，3： | 28 |
| 20 | 两种锦鸡和环颈雉线粒体DNA(mtDNA)的比较研究显示文摘本文以10种限制性内切酶分析雉科中环颈雉(Phasianus colchicus),红腹锦鸡(Chrysolopyus pictus)和白腹锦鸡(Chrysolophus amherstiae)线粒体DNA(mtDNA)。雉属与锦鸡属之间的遗传距离P为0.076(0.061—0.085),红腹锦鸡与白腹锦鸡的P为0.012。推算雉属和锦鸡属的分化大约发生在3.8×10~6年以前,红腹锦鸡与白腹锦鸡的分化大约在6×10~5年以前。这些结果表明:1.在雉科系统发生中,雉属与锦鸡属是近缘的属;2.红腹锦鸡和白腹锦鸡的分化较晚,关系密切,可能只是两个亚种。 | 张亚平 陈欣 施立明 | 1991 | Zoological Research1991，12，4： | 27 |
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